質問によると、祖父の相続（遺産分割）がまだ終わっていないようですが、そうですか？
終わっていたら、今頃特別受益（祖父の相続の問題）を云々することはおかしいことです。
あなたとしては、父の特別受益を認めるつもりのようですが、果たして、法律上そう認められるかどうかを検討する必要があります。
特別受益かどうかを判定することは、かなり難しい問題です。
法的要件として、①遺贈（金額が問題）、②婚姻、養子縁組の為又は生計の資本としての贈与（これも、金額が少なければ、該当しない。親としての扶養義務があるから…）。（民§９０３参照）

弁護士　山城　昌巳

祖父名義の不動産を一人に相続させる場合、通常は遺産分割協議書で相続人全員が署名、実印の押印、印鑑証明書添付で行うのですが、
　便法として過去に特別受益があったかなかったかにかかわらず、過去に財産をもらったから今回は相続しない旨の「特別受益証明書」を各人から集めて登記名義を変更するという方法もまれに行われています。
　お尋ねのケースも後者の方だと思います。貴方が祖父の財産を相続しなくていいのであれば、提出すれば良く、又お父様経由で相続したい場合は書いていてはいけません。
　提出する場合は、「父は過去に十分な財産をもらっているので、今回の祖父の相続には相続する財産はありません。」と記載して実印を押印し印鑑証明書を添付します。
　一方、お父様経由で相続したい場合は、遺産分割協議書を作成することによって相続する方法を選ぶことでしょう。
　税理士　高山秀三