現在、その土地についても、建物についても、それぞれ、祖母２分の１、母４分の１、おじ４分の１で、登記がなされているのでしょうか。

なお、祖父が亡くなってから、協議して上記のような登記になっているのであれば、基本的に時効取得は難しいです（祖父の登記のままであると、時効取得されてしまい、所有権がおじに移転する可能性が高くなる）。

法的措置を強行する前に、賃料収入でいいと考えれば、弁護士名義で、内容証明郵便などを出すと、払ってくる可能性はあります。
そして、それに応じないようであれば、分割請求を行う、と主張し、応じなければ、裁判所に分割請求を行うことが考えられます。