相続税の関係で言えば，

軽減措置のなかった土地の課税価格を引いた残りが
お母様の課税価格というのは，間違ってはいないと
思いますが，いかがでしょうか。


遺産分割の際の評価の問題でしたら，

税務上の軽減措置は考慮しませんので，美樹さん取得
予定の土地が路線価であれば，お母様の分も路線価
でしょう。

相続した宅地は、路線価格（倍率地域にある土地を除く）
で評価しますが、亡くなった方の居住用宅地（自宅の敷地）
については、一定面積まで、50％もしくは80％の
減額措置があります　（居住用小規模宅地の特例）
土地は利用単位ごとに評価額しますので、ご質問の12％
部分はあなたが利用しているならば、亡くなった方の
居宅敷地でないので減額措置がないので、評価額が高く
なったのではないでしょうか。

ご両親の居住用の敷地をお母様とともに相続される場合は、小規模宅地の特例は貴方にも適用されますので、問題はありませんが、
　もともとご両親の居住用敷地ではなく、貴方の家屋の敷地であった部分は、貴方とご両親の生計が一でないとすれば、誰が相続しても軽減の特例は適用ありませんので、同じになります。
　小規模宅地の減額できる敷地の解釈に間違いがあるのではないでしょうか。
　税理士　高山秀三

美樹様
兵庫県芦屋市の税理士、長嶋と申します。

土地の軽減措置は基本的には、お父様が土地を居住や事業に使っていたときに利用できるものです。

美樹様が申し出をされた土地が、居住や事業に使っていなければ、基本的には、どなたが相続しても軽減措置はありません。
相続の手続きを依頼されている税理士へ確認されることをお勧めします。